La estructura organizacional del Instituto Superior Tecnológico Tena para su organización administrativa y gestión académica se establece de la siguiente forma:
Consejo Electoral Institucional
Comisión Disciplinaria
Comité de Ética y Transparencia
Órgano Colegiado de Consulta Técnica y Tecnológica
Comisión del PEDI
Comisión de evaluación al desempeño docente
Comité de Iqualdad de Oportunidades
Coordinación Estratégica
Unidad de Planificación y Gestión de la Calidad
Unidad de Tecnologías de Información y Comunicación
Coordinación de Bienestar Institucional
Unidad de Comunicación
Unidad de Aseguramiento a la Calidad
Unidad de Relaciones Internacionales e Institucionales
Procuraduria General
Secretaria General
Dirección Administrativa Financiera
Unidad Administrativa
Unidad de Talento Humano
Unidad de Seguridad y Salud Ocupacional
Unidad de Mantenimiento e Infraestructura
Unidad de Servicios de Biblioteca
Coordinación de Tecnología Superior en Administración
Coordinación de Tecnología Superior en Desarrollo de Software
Coordinación de Tecnologia Superior Gestión de Operaciones Turisticas
Coordinación de Tecnología Superior en Desarrollo Infantil Integral
Coordinación de Técnico Superior en Seguridad Ciudadana y Orden Público
Unidad de Seguimiento a Graduados
Unidad de Integración Curricular
Coordinación de Vinculación con la Sociedad
Unidad de Prácticas Pre Profesionales
Unidad de Vinculación con la Sociedad de carrera
Centro de formación Integral y de servicios Especializados
Organismo Evaluador de la Conformidad (OEC)
Educación Continua
Organismo de Capacitación Continualoga
Coordinación de Investigación, Desarrollo Tecnológico e Innovación
Unidad de Proyectos de investigación y producción técrica
Unidad de Publicaciones
Centro de Emprendimiento Institucional
Centro de Idiomas